Kodėl Bacillus Subtilis taip plačiai naudojamas? 2 DALIS
"Pastarųjų metų darbas pakeitė mūsų požiūrį į ką B. subtilis gali veikti gyvūnų virškinimo trakte. Praeityje, B. subtilis buvo manoma, kad tai yra privalomas aerobas, kuris sporų pavidalu tiesiog pereina per daugiausia anaerobinį virškinimo traktą. Todėl buvo manoma, kad bet kokią naudą, gautą vartojant jį, lėmė tam tikra sporos savybė. Tačiau naujausi įrodymai tai rodo B. subtilis gali užbaigti visągyvenimo ciklas GI trakte pereina iš sporų į vegetatyvinę ląstelę ir vėl sporuliuoja. Tiesą sakant, augimas virškinimo trakte turi būti pakankamai tvirtas, kad galėtų konkuruoti su tokiais patogenais kaip E. coli naminių paukščių virškinimo trakte, vartojant per burną." Apibendrinant, dabartiniai duomenys rodo, kad B. subtilis's tariamas visur yra ne tik sporų išlikimo šiose aplinkose pasekmė. Vietoj to B. subtilis atrodo, kad auga įvairiose aplinkose, įskaitant dirvožemį, ant augalų šaknų ir gyvūnų virškinimo trakte. (Earl, Losick, Kolter, 2008).
Ko gali mus išmokyti genomika B. subtilis ekologija?
Šiandien mes atsidūrėme auksiniame genomikos amžiuje dėl vis paprastesnių metodų, skirtų generuoti, surinkti ir analizuoti didelius sekos informacijos kiekius.. Mums nebereikia pasikliauti vien izoliacijos geografija, elgesiu laboratorijoje ar anekdotiniais pranešimais, kad gautume vaizdą apie rūšies ekologiją. Be to, galime ištirti genus, kurie yra arba kurių nėra bet kurioje dominančioje padermėje. Prognozuojama, kad baltymų, kurie bus užkoduoti organizmo genome, tapatybė gali daug atskleisti apie šio organizmo gyvenimo būdą ir buveines, kuriose jis gyvena. Genomo seka B. subtilis 168 suteikė daug įžvalgų apie organizmo gyvenimo būdą. Remiantis nuomone, kad bakterija nėra patogenas, genų, koduojančių žinomus virulentiškumo veiksnius, nerasta. Įdomu tai, kad genomas užkodavo daugybę augalų kilmės molekulių panaudojimo būdų, sustiprindamas mintį, kad ši rūšis glaudžiai siejasi su augalais. Vienas stebėjimas paneigė ilgalaikį įsitikinimą, kad B. subtilis yra privalomas aerobas; buvo rasta genų, koduojančių spėjamą kvėpavimo nitratų reduktazę. Tai pasiūlė B. subtilis turėtų galėti augti anaerobiškai naudojant nitratą, o ne deguonį kaip elektronų akceptorių. Anaerobinis augimas B. subtilis Nuo to laiko eksperimentiškai buvo įrodyta, kad yra nitratų. Atradimas, kad B. subtilis iš tikrųjų gali augti anaerobiškai, dar labiau patvirtina mintį, kad vegetatyvinis gyvenimas daugiausia anaerobiniame gyvūnų virškinimo trakte yra įmanomas.
Tai atskleidė ir genomo seka B. subtilis santykinai didelę savo genomo dalį (~ 4%) skyrė antriniams metabolitams gaminti. Kai kurie iš šių junginių yra stiprūs grybelių ir bakterijų inhibitoriai ir greičiausiai leidžia B. subtilis konkuruoti natūralioje aplinkoje, skatina augalų augimą ir tarnauja kaip probiotikas.
Earl, AM, Losick, R. ir Kolter, R. (2008). Ekologija ir genomika Bacila subtilis. Mikrobiologijos tendencijos, 16 (6), 269–275. https://doi.org/10.1016/j.tim.2008.03.004.
