Kodėl Bacillus Subtilis taip plačiai naudojamas? 3 DALIS
"Pastarųjų metų darbas pakeitė mūsų požiūrį į ką B. subtilis gali veikti gyvūnų virškinimo trakte. Praeityje, B. subtilis buvo manoma, kad tai yra privalomas aerobas, kuris sporų pavidalu tiesiog pereina per daugiausia anaerobinį virškinimo traktą. Todėl buvo manoma, kad bet kokią naudą, gautą vartojant jį, lėmė tam tikra sporos savybė. Tačiau naujausi įrodymai tai rodo B. subtilis gali užbaigti visągyvenimo ciklas GI trakte pereina iš sporų į vegetatyvinę ląstelę ir vėl sporuliuoja. Tiesą sakant, augimas virškinimo trakte turi būti pakankamai tvirtas, kad galėtų konkuruoti su tokiais patogenais kaip E. coli naminių paukščių virškinimo trakte, vartojant per burną." Apibendrinant, dabartiniai duomenys rodo, kad B. subtilis tariamas visur yra ne tik sporų išlikimo šiose aplinkose pasekmė. Vietoj to B. subtilis atrodo, kad auga įvairiose aplinkose, įskaitant dirvožemį, augalų šaknis ir gyvūnų virškinimo traktą. (Earl, Losick, Kolter, 2008).
Šiandien mes atsidūrėme auksiniame genomikos amžiuje dėl vis paprastesnių metodų, skirtų generuoti, surinkti ir analizuoti didelius sekos informacijos kiekius. 23. Mums nebereikia pasikliauti vien izoliacijos geografija, elgesiu laboratorijoje ar anekdotiniais pranešimais, kad gautume vaizdą apie rūšies ekologiją. Be to, galime ištirti genus, kurie yra arba kurių nėra bet kurioje dominančioje padermėje. Prognozuojama, kad baltymų, kurie bus užkoduoti organizmo genome, tapatybė gali daug atskleisti apie šio organizmo gyvenimo būdą ir buveines, kuriose jis gyvena. (Earl, Losick, Kolter, 2008).
Galiausiai, atrodo, kad transformacija iš tiesų gali padėti paskatinti evoliuciją B. subtilis. Laboratorinėmis sąlygomis padermės gali paimti ir rekombinuoti iš giminaičių pridėtą genominę DNR 58. Tai gali įvykti net tarp porūšių, nors rekombinantų skaičius mažėja, nes mažėja giminystės, reiškinys vadinamas seksualine izoliacija. 58. Taip pat ankstyvieji eksperimentai, naudojant sterilizuotus dirvožemio mikrokosmosus, stebėjo, kas atsitiko, kai buvo maišomi skirtingai „pažymėti“ padermių variantai. 59. Toks pasikeitimas buvo pastebėtas net tarp skirtingų rūšių, pvz B. subtilis ir B. licheniformis 60. Tačiau pastebėtus rezultatus greičiausiai nulėmė padermių pasirinkimas, nes žinoma, kad abi naudojamos laboratorinės padermės yra daug labiau transformuojamos nei laukinės. „Hibridinių rūšių“ rekombinantai taip pat buvo nestabilūs, o tai rodo, kad rezultatai gali būti nesusiję su tuo, kas vyksta gamtoje. Tačiau atrodo, kad laukinės populiacijos B. subtilis iš tikrųjų rekombinuoja savo genus gamtoje 30. Kaip vyksta šie mainai – transformacija, transdukcija ar konjugacija – dar nenustatyta. (Earl, Losick, Kolter, 2008).
Apibendrinant, B. subtilis yra plačiai pritaikyta bakterijų rūšis, galinti augti daugybėje aplinkoje, įskaitant dirvožemį, augalų šaknis ir gyvūnų virškinimo traktą. The B. subtilis 168 genomo seka buvo svarbi priemonė, padedanti suprasti, kaip galima augti kai kuriose iš šių aplinkų. Tačiau dabar aišku, kad B. subtilis 168 genomas nepasako visos istorijos. M-CGH analizės atskleidė didelį skirtingų rūšių narių genų kintamumą. (Earl, Losick, Kolter, 2008).
Earl, AM, Losick, R. ir Kolter, R. (2008). Bacillus subtilis ekologija ir genomika. Trends in Microbiology, 16(6), 269–275. https://doi.org/10.1016/j.tim.2008.03.004.
